Il n’y a aucun micro-organisme connu résistant à l’Ultraviolet, à la différence du traitement de l’eau au chlore. L’UV est connu pour être fortement efficacecontre les bactéries, les virus, les algues. Dans la pratique, les bactéries et les virus sont la cause de nombreuses maladies pathogènes transportées par les eaux. De ces virus, le virus d’hépatite et la légionellose ont démontrés des facultés à survivre pendant des périodes considérables au traitement au chlore, mais sont aisément éliminés par un traitement UV. Pour la plupart des micro-organismes, l’efficacité des UV contre les contaminants microbiologiques tels que des bactéries et le virus dépasse généralement 99.99%.